26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1540 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1540  Limonene-12-epoxide hydrolase  100 
 
 		 146 aa  297  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12753  hypothetical protein  47.01 
 
 		 149 aa  124  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384763  normal  0.0262942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2535  Limonene-12-epoxide hydrolase  43.75 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.253274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2115  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2128  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2174  limonene-1,2-epoxide hydrolase  40 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3208  Limonene-12-epoxide hydrolase  39.13 
 
 		 147 aa  93.6  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3985  limonene-1,2-epoxide hydrolase  39.85 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.174553  normal  0.332359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2400  limonene-1,2-epoxide hydrolase  34.18 
 
 		 184 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  39.29 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0391  limonene-1,2-epoxide hydrolase  33.33 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82468  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5375  limonene-1,2-epoxide hydrolase  35.85 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4895  limonene-12-epoxide hydrolase  35.85 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2991  limonene-1,2-epoxide hydrolase  35.85 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2589  hypothetical protein  34.48 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.744125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4611  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.71 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  33.06 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2094  limonene-1,2-epoxide hydrolase  30.17 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1913  limonene-12-epoxide hydrolase  32.23 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2590  hypothetical protein  29.17 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0811  Limonene-12-epoxide hydrolase  29.41 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  27.46 
 
 		 157 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  27.46 
 
 		 157 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  27.46 
 
 		 157 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3132  hypothetical protein  29.46 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.584475  normal  0.267195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  27.08 
 
 		 157 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>