19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3985 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3985  limonene-1,2-epoxide hydrolase  100 
 
 
151 aa  303  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.174553  normal  0.332359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2400  limonene-1,2-epoxide hydrolase  60.33 
 
 
184 aa  208  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0113747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2128  limonene-1,2-epoxide hydrolase  56 
 
 
149 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2174  limonene-1,2-epoxide hydrolase  56 
 
 
149 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2115  limonene-1,2-epoxide hydrolase  56 
 
 
149 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12753  hypothetical protein  52.59 
 
 
149 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384763  normal  0.0262942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2535  Limonene-12-epoxide hydrolase  41.84 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.253274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3208  Limonene-12-epoxide hydrolase  39.42 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1540  Limonene-12-epoxide hydrolase  39.85 
 
 
146 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0391  limonene-1,2-epoxide hydrolase  39.36 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1913  limonene-12-epoxide hydrolase  34.19 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1024  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.82 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.903777  normal  0.0576424 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5692  hypothetical protein  28.21 
 
 
124 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5231  limonene-1,2-epoxide hydrolase  30.3 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.486907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  32.8 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4895  limonene-12-epoxide hydrolase  31.45 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969382  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5375  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.45 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2991  limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.45 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2094  limonene-1,2-epoxide hydrolase  35.23 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>