More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0500 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 608 aa  1185    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  44.52 
 
 		 572 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  43.74 
 
 		 597 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  44.15 
 
 		 598 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  45.22 
 
 		 574 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  43.59 
 
 		 597 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  44.35 
 
 		 573 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  43.1 
 
 		 597 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  44.58 
 
 		 597 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  43.49 
 
 		 596 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  43.46 
 
 		 597 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  43.8 
 
 		 575 aa  398  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  43.71 
 
 		 616 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  40.44 
 
 		 581 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  40.24 
 
 		 576 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  40.77 
 
 		 597 aa  375  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  41.32 
 
 		 574 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  40 
 
 		 576 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  40 
 
 		 576 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  39.83 
 
 		 576 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  40 
 
 		 576 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  40.86 
 
 		 574 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.81 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  40.52 
 
 		 574 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  41.24 
 
 		 572 aa  363  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  42.46 
 
 		 624 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  41.38 
 
 		 624 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  39.1 
 
 		 580 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  40.17 
 
 		 581 aa  362  9e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.1 
 
 		 598 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  40.28 
 
 		 574 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  40.28 
 
 		 574 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  40.07 
 
 		 610 aa  360  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  40.84 
 
 		 580 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3821  potassium/proton antiporter  40.87 
 
 		 574 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000259426  hitchhiker  0.000169781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  38.88 
 
 		 626 aa  353  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  39.51 
 
 		 580 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  39.51 
 
 		 580 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  39.41 
 
 		 580 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  39.34 
 
 		 580 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  41.99 
 
 		 569 aa  350  5e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  38.73 
 
 		 580 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  40.48 
 
 		 588 aa  346  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  41.54 
 
 		 592 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  41.49 
 
 		 580 aa  344  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  40.38 
 
 		 598 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  40.03 
 
 		 605 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  38.49 
 
 		 577 aa  342  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  40.21 
 
 		 581 aa  340  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  39.34 
 
 		 570 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  37.46 
 
 		 575 aa  336  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  38.99 
 
 		 577 aa  337  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  37.46 
 
 		 575 aa  336  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  39.31 
 
 		 577 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  39.31 
 
 		 577 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  39.31 
 
 		 577 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  39.31 
 
 		 577 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  37.54 
 
 		 573 aa  333  5e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66380  potassium/proton antiporter  40.33 
 
 		 538 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  38.83 
 
 		 582 aa  320  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01166  potassium/proton antiporter  38.64 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2457  sodium/hydrogen exchanger  38.64 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000399384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2434  potassium/proton antiporter  38.64 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010009  normal  0.436306 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01176  hypothetical protein  38.64 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0803034  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1678  potassium/proton antiporter  38.64 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113521  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1294  potassium/proton antiporter  38.64 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000808232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1957  potassium/proton antiporter  38.64 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0260417  normal  0.308586 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1336  potassium/proton antiporter  38.64 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000106159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1349  potassium/proton antiporter  38.64 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.401684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  37.25 
 
 		 541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  38.51 
 
 		 485 aa  290  4e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  40.21 
 
 		 497 aa  290  7e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0966  potassium/proton antiporter  44.28 
 
 		 596 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230877  unclonable  0.0000431742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  38.98 
 
 		 486 aa  269  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  38.59 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  41.45 
 
 		 490 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  34.02 
 
 		 498 aa  262  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  41.45 
 
 		 490 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2517  potassium/proton antiporter  39.63 
 
 		 590 aa  260  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  44.13 
 
 		 414 aa  260  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  36.23 
 
 		 487 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0650  potassium/proton antiporter  41.26 
 
 		 590 aa  258  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  40.14 
 
 		 509 aa  257  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1841  Na(+)/H(+) exchanger  35.48 
 
 		 485 aa  257  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  41.35 
 
 		 490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  38.81 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  40.56 
 
 		 499 aa  252  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  34.04 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  35.6 
 
 		 481 aa  239  8e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  42.94 
 
 		 411 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  33.04 
 
 		 477 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0927  sodium/hydrogen exchanger  37.64 
 
 		 492 aa  220  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274458 
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  34.1 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  34.3 
 
 		 496 aa  216  9e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  38.85 
 
 		 406 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  36.93 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  34.66 
 
 		 491 aa  213  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  36.74 
 
 		 530 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5829  sodium/hydrogen exchanger  35.57 
 
 		 593 aa  211  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626917  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 		 527 aa  210  6e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>