14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0379 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0379  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  345  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  34.96 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3073  hypothetical protein  29.53 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.590013  normal  0.400925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  32.89 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  28.26 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2139  hypothetical protein  29.2 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  30.4 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0389  hypothetical protein  23.39 
 
 		 138 aa  47.8  0.00008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  29.41 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  27.85 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0872  hypothetical protein  30.3 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  42.11 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  33.06 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1077  hypothetical protein  27.56 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>