44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1052 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1052  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  100 
 
 
93 aa  173  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.313485 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  81.72 
 
 
91 aa  105  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.274435 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0018  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  71.08 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2274  V-type ATP synthase subunit K  71.25 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35397  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  37.14 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175083  normal  0.827504 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.23 
 
 
139 aa  52  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.33 
 
 
142 aa  52  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.28 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  46.67 
 
 
222 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  46.67 
 
 
222 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  46.67 
 
 
222 aa  51.6  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  46.67 
 
 
222 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  50 
 
 
606 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  42.03 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03088  hypothetical protein similar to vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit (Broad)  44.07 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  40.32 
 
 
190 aa  48.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06127  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  38.82 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119546  vacuolar type H+-ATPase proteolipid subunit  31.76 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  45 
 
 
223 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69588  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  40.68 
 
 
160 aa  47  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.406866 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19430  V-type ATP synthase subunit C  57.53 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10305  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  40 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813751  normal  0.842238 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.62 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2086  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  41.94 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.185721  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.88 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  48.33 
 
 
232 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  37.31 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02690  conserved hypothetical protein  32.95 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
321 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21882  predicted protein  31.03 
 
 
170 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.854238  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29011  predicted protein  31.03 
 
 
170 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00069003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04718  vacuolar ATPase proteolipid subunit c, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08560)  34.38 
 
 
237 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1218  hypothetical protein  44.3 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000000445422  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87235  vacuolar ATPase V0 domain subunit c' (17 kDa)  28.26 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.291766 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1613  V-type ATP synthase subunit K  40.32 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.932181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2368  V-type ATP synthase subunit K  43.33 
 
 
181 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1894  V-type ATP synthase subunit K  38.71 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  35.16 
 
 
92 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>