44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0539 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0539  THUMP domain-containing protein  100 
 
 		 362 aa  716    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0117648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1622  THUMP domain-containing protein  79.21 
 
 		 364 aa  587  1e-166  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.92065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1812  THUMP domain-containing protein  75 
 
 		 360 aa  551  1e-156  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1655  THUMP domain-containing protein  73.11 
 
 		 359 aa  541  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.57853  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1772  THUMP domain-containing protein  42 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.375193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  31.76 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.33 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  46.43 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  40.68 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.08 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.17 
 
 		 482 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.73 
 
 		 484 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.33 
 
 		 482 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  26.76 
 
 		 482 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 482 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 482 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 482 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.64 
 
 		 472 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 482 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 482 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 482 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.33 
 
 		 482 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 482 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.66 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.65 
 
 		 483 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.65 
 
 		 483 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.65 
 
 		 483 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.11 
 
 		 482 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.18 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.78 
 
 		 474 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1371  putative RNA methylase  27.5 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.58 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  38.67 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.11 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  25.35 
 
 		 465 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0341  THUMP domain-containing protein  30.89 
 
 		 184 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1164  THUMP domain-containing protein  36.36 
 
 		 175 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  28.28 
 
 		 484 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  30 
 
 		 482 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  30 
 
 		 482 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  30 
 
 		 482 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  30 
 
 		 482 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  30 
 
 		 482 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  36.92 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>