31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0778 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 442 aa  879    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  35.9 
 
 		 448 aa  292  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  36.83 
 
 		 457 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 468 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0724  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3499  polysaccharide biosynthesis protein  31.14 
 
 		 451 aa  143  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2971  O antigen flippase  27.2 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.436606  hitchhiker  0.000000132287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 418 aa  103  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4935  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  20.29 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2321  putative O-antigen transporter  23.47 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0603153  normal  0.0137212 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2314  putative O-antigen transporter  25.6 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0335708 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2213  putative O-antigen transporter  25.65 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163882  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2427  putative O-antigen transporter  22.81 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.279606  hitchhiker  0.000454993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  21.19 
 
 		 513 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2595  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3186  LPS side chain defect: putative O-antigen transferase  21.01 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.15241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3785  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  20.08 
 
 		 494 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  21.34 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  30.69 
 
 		 488 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 504 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 484 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 484 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  21.7 
 
 		 488 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>