29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0432 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0432  cellulose biosynthesis protein CelD  100 
 
 		 374 aa  770    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  23.46 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5827  cellulose biosynthesis protein CelD  21.76 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  25.09 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  21.59 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2464  putative cellulose biosynthesis (CelD) protein  21.1 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2826  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.01 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2731  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  23.08 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.88 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2643  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.47 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.140676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2610  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  19.94 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.69 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2645  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.84 
 
 		 376 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0101166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29.69 
 
 		 393 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1200  hypothetical protein  22.12 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1801  cellulose biosynthesis protein CelD  19.77 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3884  hypothetical protein  20.12 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1003  hypothetical protein  25.51 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.305983  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1673  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3071  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  19.36 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1625  hypothetical protein  21.6 
 
 		 373 aa  46.6  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.370324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  20.27 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  23.76 
 
 		 336 aa  46.6  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0891  hypothetical protein  24.07 
 
 		 329 aa  46.2  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  21.78 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2696  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 		 311 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2017  hypothetical protein  21.92 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.555196  normal  0.0726848 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3973  metallophosphoesterase  31.73 
 
 		 357 aa  43.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_875  hypothetical protein  22.49 
 
 		 329 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>