35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_R0035 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu01  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 92 bp  85.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0057  tRNA-Leu  86.49 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0088  tRNA-Leu  95 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0063  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381313  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0034  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.670287  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0786  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309198  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.439755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0001  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.761083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0008  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0020  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0020  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.020101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0015  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0033  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0046  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0005  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt12  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.249535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07695  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0039  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000720687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0047  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000953822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>