46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_R0005 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0034  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 89 bp  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.670287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0063  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 89 bp  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381313  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu01  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 92 bp  75.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt12  tRNA-Leu  87.34 
 
 		 85 bp  69.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0057  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07695  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0016  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.460002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0088  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1274  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000352128  hitchhiker  0.000541618 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0046  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000111621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0980  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163209  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2105  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000470601  hitchhiker  1.53435e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2157  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00076268  hitchhiker  0.000000000132078 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2098  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000256224  hitchhiker  0.00730061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1178  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1301  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000334703  hitchhiker  0.000000433032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2681  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000136258  normal  0.046213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0040  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0035  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0051  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000584609  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00029  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000361603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4669  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.9786200000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5037  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000374172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0008  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0028  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0001  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.761083  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0866765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.115514  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0786  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309198  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.439755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000237414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000432662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0057  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0020  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0033  tRNA-Leu  82.86 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11040  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.12642  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2518    100 
 
 		 1260 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.922727  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>