More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3574 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3574  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 379 aa  786    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140517  normal  0.577765 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  30.06 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  30.11 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  30.11 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  30.79 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  30.62 
 
 		 404 aa  163  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  30.17 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  29.68 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  29.58 
 
 		 401 aa  159  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  28.81 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  29.56 
 
 		 402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  30.71 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.98 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  31.44 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  32 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  32.18 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  32.61 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  29.86 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  30.95 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  27.64 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  29 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  30.95 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  30.85 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  29.94 
 
 		 375 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  32.84 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  33.13 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  29.73 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  32.83 
 
 		 348 aa  136  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  32.44 
 
 		 348 aa  135  9e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.23 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  29.33 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  31.83 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  30.77 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  31.18 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  30.53 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  31.66 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  31.2 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  27.03 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  29.2 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  29.61 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  30.15 
 
 		 353 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  30.9 
 
 		 366 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  30.15 
 
 		 353 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  28.13 
 
 		 351 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  28.77 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  29.73 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  28.61 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  29.61 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  30.4 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.84 
 
 		 392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  29.53 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  32.74 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  29.21 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0665  threonine synthase  29.3 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  30.29 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  29.33 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  28.66 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1793  threonine synthase  29.7 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  28.36 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  33.04 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  29.43 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1821  threonine synthase  31.81 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.540438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  30.21 
 
 		 422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  26.14 
 
 		 354 aa  127  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  30.79 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  28.13 
 
 		 346 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  30.99 
 
 		 352 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  30.7 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  28.13 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  28.29 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  29.89 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  29.59 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  29.26 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  29.68 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  30.33 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  30.7 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2321  threonine synthase  29.91 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1808  threonine synthase  30.03 
 
 		 367 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.71327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  30.53 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  30.53 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  29.5 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  30.41 
 
 		 352 aa  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  31.95 
 
 		 352 aa  123  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  30.59 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  31.53 
 
 		 354 aa  122  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  30.9 
 
 		 356 aa  122  8e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  30.59 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  30.53 
 
 		 360 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  30.59 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  30.59 
 
 		 352 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  30.59 
 
 		 352 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  30.59 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2453  threonine synthase  30.33 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351882  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  27.89 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  27.43 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  27.89 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  31.23 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  28.05 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  29.41 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30231  threonine synthase  30.33 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.612563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>