More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1553 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  100 
 
 
627 aa  1264    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  57.82 
 
 
625 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  58.39 
 
 
622 aa  694    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  54.46 
 
 
463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  55.38 
 
 
463 aa  465  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  54.82 
 
 
450 aa  435  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  55.66 
 
 
453 aa  435  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  53.7 
 
 
443 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  52.71 
 
 
426 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.55 
 
 
450 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  52.93 
 
 
447 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  53.44 
 
 
444 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  51.18 
 
 
429 aa  425  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.35 
 
 
444 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  54.76 
 
 
460 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  55.08 
 
 
464 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.88 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  49.77 
 
 
435 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  50.92 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  52.24 
 
 
451 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  51.98 
 
 
456 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  51.05 
 
 
456 aa  415  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.61 
 
 
444 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  51.52 
 
 
446 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  47.65 
 
 
456 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.2 
 
 
448 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  49.88 
 
 
462 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  51.76 
 
 
444 aa  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  51.29 
 
 
460 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  53.18 
 
 
463 aa  405  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  50.46 
 
 
441 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  51.05 
 
 
450 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  53.18 
 
 
448 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  50.47 
 
 
454 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  50.8 
 
 
452 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  51.18 
 
 
458 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  50.24 
 
 
442 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  49.31 
 
 
442 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  50.47 
 
 
442 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  50.59 
 
 
442 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  45.21 
 
 
450 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  45.21 
 
 
450 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  46.03 
 
 
438 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  44.52 
 
 
453 aa  368  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  45.83 
 
 
438 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  45.33 
 
 
438 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  45.33 
 
 
438 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  45.33 
 
 
438 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  49.65 
 
 
445 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  46.01 
 
 
437 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  46.01 
 
 
437 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  46.01 
 
 
437 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  46.01 
 
 
437 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  46.01 
 
 
437 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  50.12 
 
 
418 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.6 
 
 
448 aa  355  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53800  manganese transport protein MntH  51.48 
 
 
438 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0707822  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  47.41 
 
 
391 aa  350  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  45.56 
 
 
438 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  48.64 
 
 
439 aa  342  9e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  45.63 
 
 
452 aa  342  9e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0246  manganese transport protein MntH  43.82 
 
 
444 aa  341  2.9999999999999998e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  43.58 
 
 
444 aa  339  8e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  45.02 
 
 
473 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2499  manganese transport protein MntH  47.39 
 
 
410 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.645994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  49.65 
 
 
441 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  42.86 
 
 
464 aa  331  3e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D30  manganese transporter NRAMP  42.13 
 
 
525 aa  323  6e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000755311  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  45.26 
 
 
425 aa  316  7e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0311  Mn2+/Fe2+ transporter  42.99 
 
 
449 aa  312  1e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1280  Mn2+/Fe2+ transporter  45.27 
 
 
448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.547959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  43.44 
 
 
446 aa  306  6e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  38.91 
 
 
442 aa  304  3.0000000000000004e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2025  Mn2+/Fe2+ transporter  41.13 
 
 
522 aa  303  6.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  40.97 
 
 
431 aa  303  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  40.97 
 
 
431 aa  303  9e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  40.74 
 
 
431 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  40.51 
 
 
431 aa  301  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  40.28 
 
 
431 aa  299  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1183  manganese transporter NRAMP  42.08 
 
 
473 aa  297  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1795  manganese transporter NRAMP  39.15 
 
 
532 aa  297  3e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27409  Nramp family transporter: metal ion  38.5 
 
 
489 aa  296  9e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  39.4 
 
 
432 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  42.01 
 
 
411 aa  293  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1555  Mn2+/Fe2+ transporter  38.16 
 
 
434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000268932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.27 
 
 
430 aa  290  6e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  40.53 
 
 
439 aa  289  9e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  39.35 
 
 
434 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1861  Mn2+/Fe2+ transporter  39.16 
 
 
530 aa  288  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  41.16 
 
 
409 aa  287  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  41.16 
 
 
409 aa  287  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1949  Mn2+/Fe2+ transporter  44.14 
 
 
448 aa  287  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344744  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  40.79 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  40.79 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  40.79 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.83 
 
 
432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  40.51 
 
 
431 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  40.51 
 
 
431 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  40.51 
 
 
431 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  40.51 
 
 
431 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>