20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0363 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0363  Tetratricopeptide TPR_3  100 
 
 		 602 aa  1219    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3805  Tetratricopeptide domain protein  32.59 
 
 		 595 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00975228  normal  0.247571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5521  Tetratricopeptide repeat protein  32.87 
 
 		 607 aa  280  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0375374  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3505  hypothetical protein  31.89 
 
 		 602 aa  276  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.012069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03770  hypothetical protein  29.83 
 
 		 593 aa  237  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0846  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 593 aa  165  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1963  Tetratricopeptide TPR_4  25.34 
 
 		 607 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 		 269 aa  47.4  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2146  hypothetical protein  30.77 
 
 		 604 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0587  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 		 1393 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.836601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 643 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.18 
 
 		 612 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 750 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 750 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2974  hypothetical protein  23.76 
 
 		 288 aa  44.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  29.41 
 
 		 1297 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  29.41 
 
 		 1297 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  29.41 
 
 		 1297 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  37.5 
 
 		 750 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>