211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4102 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  86.26 
 
 		 394 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  90.18 
 
 		 398 aa  711    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  80.56 
 
 		 405 aa  646    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  89.54 
 
 		 398 aa  716    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  100 
 
 		 396 aa  806    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  86.51 
 
 		 394 aa  688    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  86.48 
 
 		 399 aa  694    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  86.01 
 
 		 394 aa  666    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  85.24 
 
 		 394 aa  680    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  79.44 
 
 		 398 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  78.93 
 
 		 398 aa  617  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  55.31 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  50.39 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  54.6 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  50.13 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2956  peptidase M42 family protein  52.41 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1987  peptidase M42  51.93 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  51.66 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0220  peptidase M42 family protein  52.6 
 
 		 363 aa  355  6.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0858  peptidase M42 family protein  51.34 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0915  peptidase M42 family protein  51.07 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3392  peptidase M42 family protein  48.48 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13042  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  37.07 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  35.99 
 
 		 349 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  35.99 
 
 		 349 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  35.99 
 
 		 349 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  35.99 
 
 		 349 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  35.69 
 
 		 349 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  35.69 
 
 		 349 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  35.69 
 
 		 349 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0298  peptidase M42  39.12 
 
 		 357 aa  236  7e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  36.28 
 
 		 349 aa  236  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  37.54 
 
 		 343 aa  236  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  37.54 
 
 		 343 aa  236  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  35.71 
 
 		 349 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  35.71 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  35.12 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  38.3 
 
 		 342 aa  225  9e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  35.57 
 
 		 343 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  35.31 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  34.58 
 
 		 363 aa  198  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  32.94 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  31.66 
 
 		 344 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  31.59 
 
 		 353 aa  169  9e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  28.06 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  26.63 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2270  glucanase  28.27 
 
 		 344 aa  89.7  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4635  peptidase M42 family protein  28.61 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0148815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  26.65 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  26.22 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  24.3 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  26.98 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  23.33 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  25.64 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0681  Cellulase  23.78 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  24.19 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  24.08 
 
 		 336 aa  72.8  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  25.42 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  23.53 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1759  cellulase  27.27 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1702  cellulase  27.73 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  26.1 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  26.07 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  26.06 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0718  peptidase M42 family protein  27.3 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2745  Glutamyl aminopeptidase  24.28 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000840882  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1433  Cellulase  25.25 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  28.57 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1703  peptidase M42 family protein  24.22 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  23.29 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1335  peptidase M42 family protein  23.27 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  23.34 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  23.38 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  24.89 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0377  cellulase  25.55 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  26.58 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  27.97 
 
 		 362 aa  67  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  26.58 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1760  peptidase M42 family protein  23.61 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  22.43 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  23.89 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1045  Glutamyl aminopeptidase  23.32 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  25.86 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0433  glutamyl aminopeptidase  24.89 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1076  peptidase M42 family protein  22.87 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4829  peptidase, M42 family  22.52 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0253333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4838  M42 family peptidase  22.52 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1305  glutamyl-aminopeptidase  22.41 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000937587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2999  peptidase M42 family protein  25.99 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4446  M42 family deblocking aminopeptidase  22.22 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0268261  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0278  endo-1,4-beta-glucanase  23.57 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0687  Glutamyl aminopeptidase  20.83 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  22.8 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0177  cellulase  27.57 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  23.81 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3359  glutamyl aminopeptidase  22.92 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4813  peptidase, M42 family  21.92 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  22.8 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  22.55 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0096  peptidase M42 family protein  20.82 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.241867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>