38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3627 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  841    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5193  hypothetical protein  33.17 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.102029 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  28.43 
 
 		 416 aa  123  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  29.32 
 
 		 420 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4752  hypothetical protein  30 
 
 		 384 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0841  hypothetical cytosolic protein  26.94 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.37495  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  25.77 
 
 		 757 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  25.88 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  24.23 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0543  YcaO-like protein  24.03 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  25.57 
 
 		 745 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  27.43 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  24.64 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  28.46 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  25.77 
 
 		 745 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  25.1 
 
 		 749 aa  53.9  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  25.11 
 
 		 746 aa  53.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  24.04 
 
 		 745 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  24.04 
 
 		 745 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  26.18 
 
 		 762 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  29.72 
 
 		 397 aa  49.7  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  26.72 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  23.8 
 
 		 745 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  26.64 
 
 		 752 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  26.72 
 
 		 650 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  22.85 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  27.07 
 
 		 752 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  25.78 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  22.63 
 
 		 400 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  22.25 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  24.89 
 
 		 769 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  23.99 
 
 		 575 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  22.54 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  25.76 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1156  hypothetical protein  27.16 
 
 		 204 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  25.1 
 
 		 649 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  29.32 
 
 		 420 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  25.2 
 
 		 756 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>