89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2543 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  66.87 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  67.5 
 
 		 337 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  57.59 
 
 		 347 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  56.33 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  56.96 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  55.02 
 
 		 392 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  56.04 
 
 		 347 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  55.63 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  50.32 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  51.85 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  47.08 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  46.33 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  39.26 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  41.61 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  40.25 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  47.06 
 
 		 313 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20110  hypothetical protein  39.45 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252423  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0555  hypothetical protein  37.46 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  37.46 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3272  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  41.45 
 
 		 396 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000123433  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01080  hypothetical protein  38.54 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  31.25 
 
 		 412 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  31.53 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.62 
 
 		 391 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.49 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.62 
 
 		 385 aa  89.7  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.26 
 
 		 391 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.18 
 
 		 391 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4098  acyl-CoA dehydrogenase  28.52 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.461592  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  28.42 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0796  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.18 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585612  normal  0.628725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1346  hypothetical protein  25.55 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0806475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  31.17 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  30.52 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  33.7 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.64 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  38.75 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.24 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  29.1 
 
 		 397 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  38.75 
 
 		 406 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.75 
 
 		 393 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.5 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.75 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.91 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.94 
 
 		 433 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  24.51 
 
 		 405 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  26 
 
 		 405 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1847  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.71 
 
 		 382 aa  49.3  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.25699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.65 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  27.64 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  27.91 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.25 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.91 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.91 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.63 
 
 		 395 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  26.69 
 
 		 402 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.33 
 
 		 386 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.960119  normal  0.0627799 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1866  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  22.89 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.76 
 
 		 416 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31350  DszC-like desulfurization enzyme  26.55 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1654  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.63 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1871  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.34 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0539  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.11 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00283131 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2547  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.97 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1231  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  32 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.279686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.86 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  33.77 
 
 		 411 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  33.77 
 
 		 411 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.52 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  36.9 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.96 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1275  acyl-CoA dehydrogenase  25.45 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7179  acyl-CoA dehydrogenase  29.23 
 
 		 394 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2524  putative acyl-CoA dehydrogenase  26.61 
 
 		 417 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.73 
 
 		 416 aa  43.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  26.98 
 
 		 420 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.96 
 
 		 425 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4840  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.02 
 
 		 381 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0230  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.89 
 
 		 399 aa  42.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  26.78 
 
 		 416 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1170  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.42 
 
 		 381 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  0.0188326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>