20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2011 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2011  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  799    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05290  hypothetical protein  60.17 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0316409  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2373  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  29 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2693  hypothetical protein  26.85 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1959  hypothetical protein  28.47 
 
 		 336 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1355  hypothetical protein  28.23 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262744  normal  0.415226 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2612  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  30.12 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  24.72 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1536  hypothetical protein  27.42 
 
 		 378 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.487265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2521  hypothetical protein  30.43 
 
 		 424 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2018  cellulose biosynthesis-like protein  20.85 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.724854  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2371  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.15 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2997  hypothetical protein  23.57 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3833  hypothetical protein  28.26 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3542  hypothetical protein  28.26 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3454  hypothetical protein  24.8 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0710  cellulose biosynthesis protein CelD  26.27 
 
 		 436 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  0.329061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3984  hypothetical protein  28.26 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0723  cellulose biosynthesis protein CelD  28.4 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0683  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.82 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.320206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>