22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1642 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1642  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0452  hypothetical protein  66.67 
 
 
216 aa  291  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1278  hypothetical protein  41.94 
 
 
211 aa  165  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134242  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1179  putative secreted protein  40.74 
 
 
213 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4165  hypothetical protein  38.43 
 
 
213 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1412  putative secreted protein  39.81 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.712288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2332  hypothetical protein  41.01 
 
 
214 aa  154  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000401183  unclonable  0.00000016196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3410  hypothetical protein  37.44 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1199  hypothetical protein  38.86 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42749  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0967  hypothetical protein  28.37 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2212  hypothetical protein  27.4 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.282296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2376  hypothetical protein  27.88 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287183  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2841  hypothetical protein  31.82 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0669  hypothetical protein  29.85 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.447121  normal  0.931088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0531  hypothetical protein  30.73 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1458  hypothetical protein  29.26 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.923363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59640  hypothetical protein  30.09 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143531  hitchhiker  1.07874e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4496  hypothetical protein  27.91 
 
 
213 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.514356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3301  hypothetical protein  27.63 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3008  hypothetical protein  26.74 
 
 
223 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0640  hypothetical protein  35.38 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2930  hypothetical protein  32.94 
 
 
223 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>