298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1333 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  83.84 
 
 
688 aa  1187    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  83.84 
 
 
688 aa  1187    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  83.84 
 
 
688 aa  1187    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  83.84 
 
 
688 aa  1187    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  53.85 
 
 
723 aa  775    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  83.84 
 
 
688 aa  1187    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  83.84 
 
 
688 aa  1187    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  83.41 
 
 
688 aa  1155    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  84.09 
 
 
687 aa  1152    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  83.41 
 
 
688 aa  1155    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  100 
 
 
690 aa  1409    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  51.97 
 
 
690 aa  720    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  97.97 
 
 
690 aa  1356    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  84.09 
 
 
687 aa  1152    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  53.85 
 
 
723 aa  775    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  83.84 
 
 
688 aa  1187    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  64.49 
 
 
701 aa  931    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  83.41 
 
 
688 aa  1155    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  86.01 
 
 
687 aa  1178    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  88.66 
 
 
689 aa  1223    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  82.77 
 
 
686 aa  1183    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  53.85 
 
 
723 aa  775    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  83.41 
 
 
688 aa  1154    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  83.84 
 
 
688 aa  1188    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  65.99 
 
 
696 aa  965    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  64.48 
 
 
695 aa  875    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  83.84 
 
 
688 aa  1187    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  53.48 
 
 
694 aa  744    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  53.7 
 
 
720 aa  775    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  53.85 
 
 
720 aa  780    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  65.7 
 
 
709 aa  944    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  53.99 
 
 
720 aa  782    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  53.85 
 
 
723 aa  775    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  88.08 
 
 
689 aa  1218    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  55.36 
 
 
730 aa  788    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  55.51 
 
 
724 aa  793    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  61.86 
 
 
722 aa  886    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  53.99 
 
 
720 aa  774    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  84.09 
 
 
687 aa  1152    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  83.41 
 
 
688 aa  1155    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  43.78 
 
 
701 aa  599  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  43.47 
 
 
700 aa  569  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  43.05 
 
 
684 aa  568  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  43.99 
 
 
692 aa  562  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  39.35 
 
 
718 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  38.91 
 
 
690 aa  463  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  38.26 
 
 
715 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  36.87 
 
 
695 aa  441  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  37.59 
 
 
687 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  38.43 
 
 
700 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  37.5 
 
 
736 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  37.79 
 
 
736 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  38.1 
 
 
743 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  37.74 
 
 
690 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  36.53 
 
 
708 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  36.32 
 
 
713 aa  420  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  36.62 
 
 
720 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  36.12 
 
 
882 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  36.63 
 
 
726 aa  422  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  38.34 
 
 
679 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  36.1 
 
 
681 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  37.39 
 
 
747 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  36.9 
 
 
714 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2019  polyphosphate kinase  37.59 
 
 
723 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279845  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  36.76 
 
 
724 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0300  polyphosphate kinase  36.94 
 
 
727 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5217  polyphosphate kinase  37.24 
 
 
727 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  36.39 
 
 
731 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5842  polyphosphate kinase  36.03 
 
 
712 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5278  polyphosphate kinase  37.01 
 
 
747 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  35.12 
 
 
715 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1711  polyphosphate kinase  37.59 
 
 
736 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00451534  normal  0.547143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  37.43 
 
 
720 aa  415  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  37.16 
 
 
746 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  37.16 
 
 
709 aa  416  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  35.9 
 
 
700 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  36.61 
 
 
740 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  35.76 
 
 
702 aa  412  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  35.76 
 
 
702 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  35.76 
 
 
702 aa  412  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2160  polyphosphate kinase  36.75 
 
 
694 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  35.76 
 
 
736 aa  412  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  36.32 
 
 
691 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  35.76 
 
 
702 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  36.74 
 
 
720 aa  410  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  35.76 
 
 
702 aa  412  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  35.89 
 
 
731 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0382  polyphosphate kinase  35.99 
 
 
691 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  35.96 
 
 
702 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  35.4 
 
 
702 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  36.38 
 
 
713 aa  411  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  36.68 
 
 
710 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  35.8 
 
 
722 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  37.13 
 
 
693 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  36.8 
 
 
688 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  36.09 
 
 
693 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  35.99 
 
 
813 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  35.43 
 
 
736 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0037  polyphosphate kinase  36.43 
 
 
721 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.859837  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  35.77 
 
 
709 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>