More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4496 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  100 
 
 
389 aa  764    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  70.51 
 
 
389 aa  547  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  74.29 
 
 
388 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  74.29 
 
 
388 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  74.29 
 
 
388 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  68.12 
 
 
388 aa  497  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  62.47 
 
 
395 aa  486  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  48.64 
 
 
385 aa  322  5e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  48.64 
 
 
385 aa  322  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  47.83 
 
 
386 aa  316  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  47.2 
 
 
382 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  47.28 
 
 
384 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  45.55 
 
 
384 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  44.54 
 
 
375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  48.09 
 
 
399 aa  279  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  43.62 
 
 
390 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  42.51 
 
 
388 aa  276  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  42.51 
 
 
388 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  43.75 
 
 
392 aa  275  8e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  42.86 
 
 
384 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  43.17 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  42.35 
 
 
387 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  42.59 
 
 
384 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  41.96 
 
 
388 aa  269  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  41.91 
 
 
398 aa  266  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  44.72 
 
 
384 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  43.53 
 
 
381 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  40.71 
 
 
388 aa  260  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  42.66 
 
 
382 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  43.06 
 
 
383 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  42.66 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  41.64 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  42.98 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  41.53 
 
 
383 aa  252  7e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  41.46 
 
 
379 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  42.9 
 
 
383 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  42.55 
 
 
379 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  40.05 
 
 
387 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  39.73 
 
 
410 aa  217  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  41.01 
 
 
405 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  34.93 
 
 
371 aa  175  9e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  37.47 
 
 
397 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  33.99 
 
 
367 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  36.07 
 
 
375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  37.19 
 
 
368 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  35.48 
 
 
375 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  35.75 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  36.64 
 
 
359 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  33.6 
 
 
374 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  32.88 
 
 
367 aa  150  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  33.23 
 
 
373 aa  149  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  32.25 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  32.5 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  35 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2430  cell division protein FtsW  32.91 
 
 
398 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  30.87 
 
 
380 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  31.55 
 
 
380 aa  146  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  33.13 
 
 
368 aa  146  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  35.69 
 
 
354 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  30.79 
 
 
391 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  30.79 
 
 
391 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  32.71 
 
 
382 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1112  cell division protein FtsW  31.4 
 
 
393 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  34.92 
 
 
413 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  32.21 
 
 
368 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  31.9 
 
 
368 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  31.62 
 
 
368 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  32.21 
 
 
368 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  32.23 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  32.16 
 
 
367 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2927  cell division protein FtsW  33.24 
 
 
417 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  32.16 
 
 
367 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2270  cell cycle protein  32.96 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.011941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0957  cell division protein FtsW  32.42 
 
 
394 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.343907 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  34.2 
 
 
386 aa  139  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  32.82 
 
 
368 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  31.9 
 
 
372 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2869  cell division membrane protein-like protein  30.68 
 
 
441 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488582  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2092  cell division protein FtsW  33.96 
 
 
395 aa  139  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  32.82 
 
 
371 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2194  cell division protein FtsW  35.42 
 
 
401 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.689364  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  31.6 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  31.6 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0449  cell division protein FtsW  35.93 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  31.6 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  31.6 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0177  cell cycle protein  32.98 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.186002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2615  cell division protein FtsW  31.77 
 
 
397 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000584566 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  29.89 
 
 
378 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  29.59 
 
 
374 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3925  cell division protein FtsW  30.54 
 
 
543 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424202  normal  0.252874 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  32.32 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  34.43 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00090  integral membrane protein involved in stabilizing FstZ ring during cell division  30 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3511  cell division protein FtsW  30 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0095  cell division protein FtsW  30 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.747639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0091  cell division protein FtsW  30 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00890066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00089  hypothetical protein  30 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12070  rod shape-determining protein  33.95 
 
 
367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0094  cell division protein FtsW  30 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>