50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2934 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2934  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 215 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.55 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0112  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.75 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6361  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase protein  42.57 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368915  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  39.72 
 
 		 252 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6182  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.26 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130047  normal  0.343003 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.13 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.74 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.61 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.16 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.16 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.85 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.12 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.8 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.8 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.55 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.8 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.2 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.09 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.02 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.02 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.02 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.83 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.41 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  25.52 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.48 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.37 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  33.33 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.73 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.86 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.85 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  28.7 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.22 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2373  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.52 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.486813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.33 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.55 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.18 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3841  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.37 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.14 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.36 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.35 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.14 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.86 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.23 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  29.58 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.55 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.65 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>