26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1881 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1881  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  232  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  48.06 
 
 		 134 aa  116  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  44.83 
 
 		 181 aa  97.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  47.42 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  47.42 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  52.56 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  45.54 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  33.06 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  34.41 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  32.17 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  32.17 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  31.71 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  29.91 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  31.67 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  32.76 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  29.84 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  29.84 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  31.82 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  38.16 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  34.29 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  24.11 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  29.87 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  30.38 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  31.33 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  28.4 
 
 		 127 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>