More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1791 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1791  maf protein  100 
 
 
213 aa  420  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.868606  normal  0.765103 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3556  maf protein  57.38 
 
 
193 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0983  maf protein  60.32 
 
 
194 aa  211  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  55.98 
 
 
190 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1915  maf protein  55.91 
 
 
190 aa  194  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0359898  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2752  maf protein  54.27 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  56.99 
 
 
199 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3344  maf protein  54.82 
 
 
215 aa  187  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0322  Maf-like protein  55.56 
 
 
208 aa  187  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4312  maf protein  54.31 
 
 
215 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2628  maf protein  54.92 
 
 
223 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.641863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2852  maf protein  54.92 
 
 
223 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0625  putative Maf-like protein  60 
 
 
192 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0600  maf protein  58.93 
 
 
192 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0248  Maf-like protein  54.3 
 
 
208 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.50126  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2952  maf protein  54.55 
 
 
217 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0757  maf protein  51.96 
 
 
215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00314936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2277  maf protein  59.52 
 
 
192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.440885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  55.38 
 
 
210 aa  180  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  51.52 
 
 
206 aa  180  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1131  maf protein  54.05 
 
 
208 aa  180  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0485001 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0266  Maf-like protein  53.76 
 
 
208 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000929962  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0212  Maf-like protein  50 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.756505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  52.08 
 
 
207 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1057  maf protein  54.5 
 
 
201 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4276  Maf-like protein  51.3 
 
 
207 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0849275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  51.04 
 
 
209 aa  174  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2691  maf protein  54.89 
 
 
188 aa  174  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140369  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1675  maf protein  49.52 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.251524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3584  maf protein  53.26 
 
 
201 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.85148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2138  maf protein  54.55 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0900  Maf-like protein  52.13 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2725  maf protein  55 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0292  Maf-like protein  51.83 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  51.56 
 
 
194 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4414  Maf-like protein  50.78 
 
 
207 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699911  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0525  maf protein  50.76 
 
 
200 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4160  Maf-like protein  52.91 
 
 
200 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3819  maf protein  50.76 
 
 
200 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  50.78 
 
 
207 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0277  Maf-like protein  51.83 
 
 
207 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31345  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3469  maf protein  49.49 
 
 
194 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.141262  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0482  maf protein  49.49 
 
 
194 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.556215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0500  maf protein  50.76 
 
 
200 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00570929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0521  maf protein  50.76 
 
 
200 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  49.49 
 
 
194 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0638  Maf-like protein  49.74 
 
 
206 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0212  septum formation protein Maf  47.78 
 
 
220 aa  165  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.37399e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4111  maf protein  54.59 
 
 
213 aa  165  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0881  maf protein  46.49 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.215689  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0333  Maf-like protein  45.74 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  48.91 
 
 
195 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  48.91 
 
 
195 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  54.55 
 
 
196 aa  161  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0859  Maf-like protein  53.48 
 
 
198 aa  161  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0243  Maf-like protein  49.74 
 
 
206 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0271  Maf-like protein  49.74 
 
 
206 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58110  Maf-like protein  52.63 
 
 
201 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  47.18 
 
 
198 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0406  maf protein  50.81 
 
 
196 aa  155  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  48.13 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4469  maf protein  51.85 
 
 
200 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  52.72 
 
 
194 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  48.63 
 
 
192 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2125  maf protein  53.26 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0385886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  53.26 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  50.27 
 
 
201 aa  151  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4399  maf protein  46.04 
 
 
205 aa  151  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0518  Maf-like protein  44.2 
 
 
192 aa  150  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0512  Maf-like protein  42.54 
 
 
192 aa  150  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3751  maf protein  47.89 
 
 
198 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  50.27 
 
 
203 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4557  septum formation protein Maf  45.03 
 
 
212 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2237  maf protein  49.21 
 
 
200 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0561  maf protein  47.12 
 
 
198 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.429106  normal  0.272101 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  48.07 
 
 
192 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  52.75 
 
 
194 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1940  maf protein  45.92 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0271564  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  51.34 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2081  Maf-like protein  44.62 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1974  Maf-like protein  46.67 
 
 
202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  41.24 
 
 
196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  48.13 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1737  maf protein  46.6 
 
 
207 aa  144  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3197  maf protein  47.52 
 
 
202 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99903  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3823  maf protein  46.27 
 
 
206 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.778182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  51.37 
 
 
205 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0363  maf protein  47.98 
 
 
207 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  49.46 
 
 
196 aa  142  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0779  Maf-like protein  46.97 
 
 
200 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2438  Maf-like protein  47.45 
 
 
203 aa  141  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0943  Maf-like protein  51.35 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.706065  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3526  maf protein  45.23 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  48.04 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  45.16 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0612  maf protein  45.92 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  41.99 
 
 
192 aa  138  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  46.49 
 
 
191 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5092  Maf-like protein  50.79 
 
 
201 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  46.7 
 
 
207 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>