61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1736 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1736  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.387479  normal  0.0591392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2600  hypothetical protein  71.8 
 
 		 272 aa  374  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1808  protein of unknown function DUF451  62.88 
 
 		 281 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3311  hypothetical protein  58.27 
 
 		 278 aa  323  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1957  hypothetical protein  58.94 
 
 		 275 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3856  hypothetical protein  62.59 
 
 		 275 aa  308  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2783  hypothetical protein  62.06 
 
 		 373 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1661  hypothetical protein  61.85 
 
 		 375 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1259  hypothetical protein  60.08 
 
 		 375 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.564709 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1546  hypothetical protein  60.84 
 
 		 375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391559  normal  0.123429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  60.08 
 
 		 375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2578  hypothetical protein  59.7 
 
 		 375 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0453581 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2625  conserved hypothetical protein  59.7 
 
 		 375 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0630269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1133  hypothetical protein  59.7 
 
 		 375 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0150694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01020  hypothetical protein  59.7 
 
 		 375 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01027  hypothetical protein  59.7 
 
 		 375 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.210857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1137  hypothetical protein  59.7 
 
 		 375 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2928  hypothetical protein  59.92 
 
 		 378 aa  301  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000108571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3370  hypothetical protein  61.02 
 
 		 285 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3599  hypothetical protein  61.42 
 
 		 274 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2041  hypothetical protein  61.13 
 
 		 376 aa  296  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.117906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2263  hypothetical protein  60.73 
 
 		 376 aa  295  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3144  hypothetical protein  60.57 
 
 		 374 aa  294  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2365  hypothetical protein  60.73 
 
 		 376 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0102412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2875  hypothetical protein  61.42 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0432  hypothetical protein  58.58 
 
 		 371 aa  285  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3279  hypothetical protein  46.18 
 
 		 295 aa  248  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  45.8 
 
 		 375 aa  205  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5685  hypothetical protein  42.74 
 
 		 376 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3368  hypothetical protein  40.24 
 
 		 403 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0438739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3597  hypothetical protein  39.44 
 
 		 402 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3351  protein of unknown function DUF451  44.07 
 
 		 385 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4774  hypothetical protein  41.18 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  40.73 
 
 		 396 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1951  hypothetical protein  39.92 
 
 		 378 aa  178  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1024  hypothetical protein  39 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000003997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4288  hypothetical protein  42.62 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1810  protein of unknown function DUF451  44.5 
 
 		 386 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0401  hypothetical protein  37.5 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0391  hypothetical protein  37.5 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7008  hypothetical protein  37.05 
 
 		 393 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926109  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2873  hypothetical protein  39.48 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107096  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  36.14 
 
 		 396 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4621  hypothetical protein  38.49 
 
 		 309 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4328  hypothetical protein  38.49 
 
 		 309 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1567  Peptidase M75, Imelysin  39.23 
 
 		 404 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3899  hypothetical protein  36.47 
 
 		 410 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0203467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25530  predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport  38.74 
 
 		 406 aa  158  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0819691  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0189  hypothetical protein  37.39 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0428055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0230  hypothetical protein  37.82 
 
 		 409 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4912  hypothetical protein  36.69 
 
 		 418 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4242  hypothetical protein  37.99 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2598  hypothetical protein  34.66 
 
 		 395 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1734  hypothetical protein  38.19 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0725409  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  30.96 
 
 		 691 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7481  iron permease FTR1  27.62 
 
 		 438 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3313  hypothetical protein  28.57 
 
 		 375 aa  95.5  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6260  iron permease FTR1  30.7 
 
 		 400 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.324266 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  25.96 
 
 		 702 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1955  putative lipoprotein  28.52 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0906256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  23.73 
 
 		 677 aa  62.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>