More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1736 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1736  NifC-like ABC-type porter  100 
 
 
270 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  32.8 
 
 
266 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  32.4 
 
 
266 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  32.4 
 
 
266 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  39.34 
 
 
266 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.07 
 
 
274 aa  158  9e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  38.74 
 
 
270 aa  158  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.08 
 
 
293 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1823  NifC-like ABC-type porter  40.62 
 
 
263 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0891  NifC-like ABC-type porter  37.89 
 
 
273 aa  155  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.966064  normal  0.181406 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1320  NifC-like ABC-type porter  38.3 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0211  NifC-like ABC-type porter  37.02 
 
 
288 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.86371  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.18 
 
 
282 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2207  NifC-like ABC-type porter  43.01 
 
 
272 aa  149  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
213 aa  149  7e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2900  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.56 
 
 
263 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3448  NifC-like ABC-type porter  42.93 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.88 
 
 
282 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.62 
 
 
273 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  34.98 
 
 
269 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 
262 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  42.78 
 
 
222 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2651  NifC-like ABC-type porter  34.04 
 
 
279 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  31.97 
 
 
270 aa  136  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0414  molybdate ABC transporter permease  40.1 
 
 
228 aa  135  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1709  molybdate ABC transporter permease  39.78 
 
 
228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1599  NifC-like ABC-type porter  31.8 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1761  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.25 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.48 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.93 
 
 
295 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.79 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  33.64 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.33 
 
 
223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.67 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.94 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.14 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  37.2 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.76 
 
 
221 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1974  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.24 
 
 
227 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1376  sulfate ABC transporter permease protein CysT  33.03 
 
 
282 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  36.67 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.48 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.48 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 
225 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0474  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
228 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0505  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.94 
 
 
278 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.842115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.19 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1667  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.92 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0557  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.27 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.49996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4653  sulfate ABC transporter, permease protein  32.29 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  34.19 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  33.81 
 
 
225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3322  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.01 
 
 
227 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2009  NifC-like ABC-type porter  34.63 
 
 
271 aa  125  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.744846  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.13 
 
 
221 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.33 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9030  ABC-type molybdate transport system permease component-like protein  36.93 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466307  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0593  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.95 
 
 
284 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0582  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.95 
 
 
284 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.513137  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2039  NifC-like ABC-type porter  31.28 
 
 
267 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4343  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.95 
 
 
279 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.279119  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2612  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.17 
 
 
227 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3805  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.28 
 
 
277 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  36.19 
 
 
238 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.02 
 
 
227 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0373  sulfate transport protein CysT  31.98 
 
 
272 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1392  molybdate ABC transporter permease  34.68 
 
 
226 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3185  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.92 
 
 
283 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0883923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.59 
 
 
259 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03680  sulfate transport protein CysT  31.58 
 
 
272 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000172641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.25 
 
 
291 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
268 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.24033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.73 
 
 
224 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  35.98 
 
 
241 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.43 
 
 
289 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.32 
 
 
224 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1097  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.48 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.15 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1332  NifC-like ABC-type porter  30.34 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77649  normal  0.0142467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.65 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0732  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.38 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  36.97 
 
 
601 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1389  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.89 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1045  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.43 
 
 
270 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2950  sulfate/thiosulfate transporter subunit  29.79 
 
 
277 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.529327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02517  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  34.62 
 
 
270 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.11 
 
 
308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2802  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.47 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0258  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  32.37 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2532  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000130184  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.57 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.57 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.63 
 
 
277 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  36.46 
 
 
602 aa  119  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>