More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1661 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  265  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  70.65 
 
 		 94 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  69.57 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  72.73 
 
 		 91 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  67.39 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  65.56 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  67.42 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  60.22 
 
 		 101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  55.81 
 
 		 98 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  53.26 
 
 		 95 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  54.65 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 98 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  43.21 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  40.22 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0221  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0200  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0013228  hitchhiker  4.7495300000000004e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1906  regulatory protein ArsR  43.37 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0244  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10115e-49 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  53.03 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2463  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000234537  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0048  transcriptional regulator, ArsR family protein  45.07 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0663056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2328  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2201  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00183018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2140  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00329854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2123  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000110914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2363  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2382  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2996  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00129565  normal  0.033071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2393  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0242789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2171  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0439276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0127  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196561  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5558  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249021 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  37.89 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3065  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0166  transcriptional repressor PagR  39.08 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3305  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5478  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.350529  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2840  transcriptional repressor PagR  41.03 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.660839  hitchhiker  0.0000000107753 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0207  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.239951  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0145  transcriptional repressor PagR, putative  41.25 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0268  transcriptional repressor PagR  41.25 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0320  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0069  transcriptional repressor PagR  39.02 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0051  transcriptional repressor  37.78 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  37.93 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2343  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  35.8 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0160  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 101 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  43.28 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  37.18 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  44.12 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>