More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1095 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1095  NADH-dependent butanol dehydrogenase II  100 
 
 
396 aa  813    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  81.27 
 
 
395 aa  663    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.92 
 
 
387 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0850  NADH-dependent butanol dehydrogenase  42.86 
 
 
390 aa  319  5e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.794812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0842  NADH-dependent butanol dehydrogenase  42.36 
 
 
390 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.828301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.13 
 
 
385 aa  315  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.11 
 
 
391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 
387 aa  311  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0241  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.31 
 
 
389 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  42.32 
 
 
394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3479  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  41.16 
 
 
387 aa  309  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.029085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3485  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.41 
 
 
387 aa  308  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3465  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  41.41 
 
 
387 aa  308  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3729  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.16 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.11531e-21 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2463  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.16 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1483  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.16 
 
 
387 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.575813  hitchhiker  0.00657917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3747  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.16 
 
 
387 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0271369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3819  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.15 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3770  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.66 
 
 
387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.75 
 
 
388 aa  299  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2537  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.65 
 
 
392 aa  292  8e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1024  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 
388 aa  288  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.2 
 
 
389 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3824  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.19 
 
 
386 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0469  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0101789 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1710  NADH-dependent butanol dehydrogenase  37.25 
 
 
395 aa  268  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.69 
 
 
384 aa  266  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2513  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent, iron-containing  37.88 
 
 
385 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330042  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 
395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2599  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.71 
 
 
382 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1382  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 
388 aa  252  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.422911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01218  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
384 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0781  iron-containing alcohol dehydrogenase  36 
 
 
395 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 
398 aa  247  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0106  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 
395 aa  247  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00140728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3337  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.25 
 
 
391 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0808546  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1120  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
397 aa  246  4.9999999999999997e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0107  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.33 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000469096  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1566  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
395 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2911  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.92 
 
 
390 aa  240  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1157  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 
382 aa  239  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00089596  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.03 
 
 
393 aa  240  4e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1511  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.57 
 
 
390 aa  239  8e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3765  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
387 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1872  Oxidoreductase  36.34 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172761  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0946  NADH-dependent butanol dehydrogenase  37.5 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000148725  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1285  NADH-dependent butanol dehydrogenase a  35.18 
 
 
381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.16188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02884  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent  36.34 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0688  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3479  alcohol dehydrogenase yqhD  36.34 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0685  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02834  hypothetical protein  36.34 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3439  alcohol dehydrogenase yqhD  36.34 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3188  alcohol dehydrogenase yqhD  36.34 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3296  alcohol dehydrogenase yqhD  36.34 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.495379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1559  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 
390 aa  234  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000187518  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000212  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1096  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.92 
 
 
402 aa  233  5e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.149705  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0073  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.82 
 
 
395 aa  233  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
382 aa  233  5e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4215  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
387 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1700  putative oxidoreductase  36.59 
 
 
384 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07410  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
402 aa  232  7.000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4322  alcohol dehydrogenase yqhD  36.07 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1645  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.93 
 
 
383 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0757662  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1126  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
386 aa  230  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0760  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
385 aa  229  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.473992  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00850  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
390 aa  229  8e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3348  alcohol dehydrogenase YqhD  36.03 
 
 
387 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.838329  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3603  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 
387 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3339  alcohol dehydrogenase YqhD  35.75 
 
 
387 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3413  alcohol dehydrogenase YqhD  35.75 
 
 
387 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3514  alcohol dehydrogenase YqhD  35.75 
 
 
387 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3419  alcohol dehydrogenase YqhD  35.75 
 
 
387 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0271  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.69 
 
 
385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0587  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.69 
 
 
385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0050  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.79 
 
 
414 aa  226  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05947  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 
397 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1151  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.92 
 
 
382 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2158  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 
385 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3422  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
387 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2016  NADH-dependent butanol dehydrogenase a (bdh i)  34.49 
 
 
381 aa  224  2e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000217256  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1900  biotin carboxyl carrier protein  34.99 
 
 
381 aa  223  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0070  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
387 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0263  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 
385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0267  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 
385 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4469  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.01 
 
 
385 aa  222  8e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1437  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1715  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.95 
 
 
389 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131652  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0377  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3349  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.77 
 
 
385 aa  219  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0753084  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0380  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
387 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2347  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
386 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.820905  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0261  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.69 
 
 
385 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883451  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 
385 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>