More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0998 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0998  dihydropteroate synthase  100 
 
 
306 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  55.76 
 
 
413 aa  285  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  55.81 
 
 
400 aa  276  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  53.15 
 
 
290 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  53.43 
 
 
278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  54.58 
 
 
278 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  56.83 
 
 
303 aa  258  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  57.41 
 
 
284 aa  258  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  48.67 
 
 
393 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  46.79 
 
 
270 aa  245  8e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  46.33 
 
 
400 aa  243  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  44.28 
 
 
278 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  45.32 
 
 
287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  43.17 
 
 
278 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  50 
 
 
291 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  48.19 
 
 
283 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  47.74 
 
 
402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  45.66 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  45.66 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  48.79 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  45.66 
 
 
277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 
345 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 
345 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 
376 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  47.35 
 
 
282 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  46.97 
 
 
282 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  46.97 
 
 
282 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  46.97 
 
 
282 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  46.97 
 
 
282 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  46.97 
 
 
282 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  46.97 
 
 
282 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  46.97 
 
 
282 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 
280 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  46.97 
 
 
282 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  45.18 
 
 
394 aa  228  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  43.91 
 
 
282 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  47.08 
 
 
286 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  46.39 
 
 
277 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  48.65 
 
 
394 aa  225  6e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  45.06 
 
 
266 aa  224  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  43.53 
 
 
274 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 
282 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  46.1 
 
 
399 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 
282 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 
282 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 
282 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  45.32 
 
 
279 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 
282 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 
269 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 
347 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 
269 aa  222  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 
285 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  45.63 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 
279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 
282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 
277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  46.97 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 
279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 
277 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  50 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  46.27 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  47.53 
 
 
294 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  50 
 
 
283 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  46.82 
 
 
291 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  50 
 
 
283 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  42.06 
 
 
275 aa  216  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2398  dihydropteroate synthase  47.92 
 
 
337 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  43.61 
 
 
277 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  46.01 
 
 
298 aa  215  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  42.37 
 
 
286 aa  215  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 
282 aa  215  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  50.41 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  41.44 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  43.06 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  41.01 
 
 
397 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  45.17 
 
 
277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
356 aa  212  5.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  43.63 
 
 
277 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  45.16 
 
 
285 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  53.44 
 
 
280 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  42.11 
 
 
290 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0648  dihydropteroate synthase  48.59 
 
 
345 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  46.91 
 
 
283 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0505  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
303 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.183245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  44.79 
 
 
280 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
286 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  41.64 
 
 
301 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  44.79 
 
 
277 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12107  predicted protein  47.08 
 
 
460 aa  209  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  45.82 
 
 
283 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 
277 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
280 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  44.4 
 
 
280 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  44.4 
 
 
280 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
280 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
277 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>