More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0988 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0988  regulatory protein CII  100 
 
 
343 aa  710    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  41.16 
 
 
356 aa  268  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  35.63 
 
 
343 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.74 
 
 
353 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2369  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.42 
 
 
342 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.28 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.59 
 
 
443 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 
472 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.49 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.91 
 
 
323 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.5 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.03 
 
 
366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.96 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26 
 
 
353 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  28.11 
 
 
365 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.01 
 
 
340 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 
366 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.42 
 
 
330 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.86 
 
 
340 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.38 
 
 
254 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3388  hypothetical protein  32.08 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853943  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.81 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.38 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  29.47 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.69 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  29.21 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.35 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.6 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N36  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  25.29 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.74 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0435  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.1 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 
362 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.9 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.68 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.36 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.68 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.68 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  26 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  31.09 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  29.85 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.93 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.68 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  25.59 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  27.59 
 
 
276 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.33 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  27 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
309 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  27.18 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.22 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  27.36 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.5 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  27.32 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.78 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.78 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  25.73 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  27.76 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.03 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  29.84 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  25.19 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.64 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.72 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  26.89 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.84 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.56 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.43 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  27.91 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  27.09 
 
 
293 aa  67  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.23 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.74 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.59 
 
 
317 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  29.67 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  29.38 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.05 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  28.23 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.23 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.5 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4471  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.03 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  29.59 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.59 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  28.57 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.05 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.94 
 
 
284 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.53 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3786  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116138  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0987  partition protein, ParA-like  26.5 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.000325119  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.36 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5494  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.82 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>