87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0338 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.73 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  46.15 
 
 		 331 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.27 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.62 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  40.62 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  41.54 
 
 		 329 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  39.06 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  40 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.46 
 
 		 326 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  44.62 
 
 		 374 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  41.79 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1856  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1573  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  38.46 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 78 aa  47.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.87 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19401  hypothetical protein  37.04 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.952724 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 211 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.33 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.77 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.85 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0895  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1158  sulfur transfer protein for thiamine biosynthesis  34.38 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.85 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 73 aa  40.8  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.31 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.75 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  32.81 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1841  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16951  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.277619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  39.06 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  39.06 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 65 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>