28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1737 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1737  tRNA CCA-pyrophosphorylase  100 
 
 		 418 aa  842    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.672198 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1560  tRNA CCA-pyrophosphorylase  71.77 
 
 		 415 aa  627  1e-178  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0570  tRNA CCA-pyrophosphorylase  68.59 
 
 		 418 aa  622  1e-177  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.07195  hitchhiker  0.00173806 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1740  tRNA CCA-pyrophosphorylase  68.42 
 
 		 418 aa  618  1e-176  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.753345  decreased coverage  0.000389887 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0998  tRNA CCA-pyrophosphorylase  42.22 
 
 		 455 aa  339  7e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465929  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0511  CCA-adding enzyme  34.49 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1784  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.97 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2010  CCA-adding enzyme  35.32 
 
 		 412 aa  230  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1130  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.05 
 
 		 446 aa  219  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0015444  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0562  tRNA cytidylyltransferase  33.09 
 
 		 450 aa  219  6e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.26699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1782  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.04 
 
 		 443 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0323  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.75 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2014  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.68 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0644301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2250  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.58 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.218879  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0675  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.03 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0369  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.47 
 
 		 464 aa  209  5e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0336  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.7 
 
 		 462 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.0285087 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1256  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.15 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.162335  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.58 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0240  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.72 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.788854  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0196  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.41 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.79483 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0013  tRNA CCA-pyrophosphorylase  34.58 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0418  CCA-adding enzyme  30.7 
 
 		 494 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0756  tRNA CCA-pyrophosphorylase  31.75 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.155952  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0368  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.27 
 
 		 467 aa  195  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2808  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.01 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.7 
 
 		 459 aa  193  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.71826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2208  CCA-adding enzyme  31.74 
 
 		 497 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>