More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3246 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 338 aa  701    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  75.37 
 
 		 340 aa  532  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  70.75 
 
 		 341 aa  494  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  71.43 
 
 		 339 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  71.43 
 
 		 337 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  70.83 
 
 		 337 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  70.24 
 
 		 337 aa  488  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  71.13 
 
 		 337 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  70.54 
 
 		 337 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  70.54 
 
 		 337 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  69.55 
 
 		 338 aa  481  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  69.85 
 
 		 337 aa  481  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  70.15 
 
 		 337 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  69.85 
 
 		 337 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  70.15 
 
 		 337 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  68.75 
 
 		 336 aa  474  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  69.25 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  66.27 
 
 		 336 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1722  UDP-galactose 4-epimerase  63.58 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  63.8 
 
 		 341 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2597  UDP-glucose 4-epimerase  65.77 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.305151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  63.17 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  62.31 
 
 		 339 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  61.98 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  62.5 
 
 		 337 aa  443  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  62.57 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  61.38 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  64.29 
 
 		 335 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  61.19 
 
 		 338 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  64.29 
 
 		 335 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  61.38 
 
 		 336 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  62.39 
 
 		 337 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  62.57 
 
 		 338 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  60.95 
 
 		 337 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  61.19 
 
 		 338 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  60.87 
 
 		 353 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  61.24 
 
 		 342 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  61.79 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  62.99 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  62.57 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  61.79 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1101  UDP-glucose 4-epimerase protein  61.13 
 
 		 341 aa  434  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.139946  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  60.9 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  60.9 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  61.86 
 
 		 352 aa  434  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  62.99 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  60.9 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3834  UDP-galactose 4-epimerase  61.19 
 
 		 342 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  61.08 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  63.99 
 
 		 335 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  61.08 
 
 		 336 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2943  UDP-galactose-4-epimerase  59.58 
 
 		 338 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  60.6 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  62.09 
 
 		 337 aa  431  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  61.31 
 
 		 339 aa  431  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2855  UDP-galactose-4-epimerase  59.58 
 
 		 338 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4235  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  61.08 
 
 		 338 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1413  UDP-galactose-4-epimerase  59.28 
 
 		 338 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  60.71 
 
 		 338 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  60.78 
 
 		 338 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4345  UDP-glucose 4-epimerase  59.94 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697217  normal  0.478622 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  60.42 
 
 		 338 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  58.81 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  60.78 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  61.31 
 
 		 340 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2339  UDP-galactose 4-epimerase  59.4 
 
 		 349 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569597  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  59.29 
 
 		 340 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  61.9 
 
 		 337 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  58.88 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  62.13 
 
 		 339 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  61.4 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0468  UDP-glucose 4-epimerase  60.42 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  58.68 
 
 		 339 aa  424  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3049  uridine diphosphate N-acetylgalactosamine 4-epimerase  61.98 
 
 		 335 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  58.21 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  59.47 
 
 		 341 aa  423  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  60.48 
 
 		 337 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  61.49 
 
 		 340 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  58.28 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  58.98 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  59.88 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  58.98 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  58.98 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  58.68 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2824  UDP-galactose 4-epimerase  59.05 
 
 		 351 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  59.88 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  61.19 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  59.58 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  61.01 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  55.69 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  59.58 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  60.91 
 
 		 335 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0116  UDP-glucose 4-epimerase  61.42 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  58.98 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  58.98 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  59.88 
 
 		 338 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  58.68 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  58.98 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2015  UDP-glucose 4-epimerase  58.68 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>