27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2901 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2901  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  280  8.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  61.27 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  56.15 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2858  hypothetical protein  53.71 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  63.33 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2241  hypothetical protein  49.68 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  50.38 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1763  hypothetical protein  49.62 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00142931  hitchhiker  0.00932404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2580  hypothetical protein  49.62 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0433297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  49.32 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  49.67 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  45.93 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2332  hypothetical protein  44.52 
 
 		 143 aa  84.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00550245  hitchhiker  0.00911187 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01093  hypothetical protein  65.57 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2451  hypothetical protein  46.73 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0669887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  44.44 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  44.44 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2308  hypothetical protein  50.88 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0781022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3152  hypothetical protein  37.88 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2636  hypothetical protein  37.39 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.82206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2413  hypothetical protein  53.33 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  47.69 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  36.84 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  39.25 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  40.48 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1776  hypothetical protein  50.94 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.597953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1787  hypothetical protein  47.62 
 
 		 143 aa  40.8  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000888061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>