14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2600 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2600  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  517  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.370975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  36.36 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3130  hypothetical protein  31.5 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2466  hypothetical protein  38.82 
 
 		 119 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4938  hypothetical protein  25.52 
 
 		 347 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.853403  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1451  hypothetical protein  21.97 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0409  putative lipoprotein  34.83 
 
 		 356 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  33.8 
 
 		 302 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  33.8 
 
 		 313 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4791  hypothetical protein  28.89 
 
 		 443 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  28.89 
 
 		 388 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0627  SH3 type 3 domain protein  25.15 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.496053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1484  hypothetical protein  32.31 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  31.94 
 
 		 317 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>