176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2308 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2308  putative esterase  100 
 
 
270 aa  565  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2890  ATPase  51.13 
 
 
274 aa  291  9e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.418152  hitchhiker  0.00752314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0649  putative esterase  39.11 
 
 
268 aa  195  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0397008  normal  0.263924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  28.88 
 
 
289 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  30.38 
 
 
296 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  30.45 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  30.45 
 
 
286 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0957  putative esterase  27.23 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  31.11 
 
 
295 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  31.11 
 
 
295 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  30.22 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  28.64 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  31.11 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3261  putative esterase  32.65 
 
 
199 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0186  putative esterase  28.57 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  27.92 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  26.94 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  29.03 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2109  putative esterase  30.49 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0655634  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  27.69 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1260  putative esterase  26.43 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4810  putative esterase  25.52 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  26.2 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  27.27 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1940  esterase  26.11 
 
 
258 aa  79  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000237899  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1536  putative esterase  31.91 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.88087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6266  putative esterase  30.84 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0970  putative esterase  28.23 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  26.15 
 
 
640 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02190  predicted esterase  24.55 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  25.82 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3201  putative esterase  24.35 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  25.57 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  27.63 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  23.71 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  23.4 
 
 
560 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  34.4 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  23.14 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  27.98 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  25.68 
 
 
638 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0767  putative esterase  27.17 
 
 
395 aa  68.6  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.313177  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1371  putative esterase  24.02 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0978  putative esterase  26.72 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0423  putative esterase  26.87 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.08 
 
 
640 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1007  putative esterase  26.72 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  24.4 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1483  esterase  24.67 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0425  esterase, putative  24.69 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.2797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1582  putative esterase  24.35 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10530  hypothetical protein  27.48 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10789  hypothetical protein  29.68 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1101  putative esterase  32.26 
 
 
341 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2744  putative esterase  27.19 
 
 
366 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1557  esterase  25.21 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  26.47 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1221  enterochelin esterase and related enzyme  27.94 
 
 
341 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2245  tributyrin esterase EstA, putative  20.25 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1192  putative esterase  25.64 
 
 
343 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.477503  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2411  putative esterase  26.32 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000101635  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0425  putative esterase  32.62 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3780  putative esterase  24.37 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3836  putative esterase  28.8 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0986  putative esterase  31.08 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3361  putative esterase  24.92 
 
 
369 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.151349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4570  putative esterase  30.82 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263856  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0720  esterase  22.03 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.276052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4658  putative esterase  30.82 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4953  putative esterase  30.82 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.154842 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2653  putative esterase  20.99 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2709  putative esterase  20.99 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  26.05 
 
 
305 aa  59.3  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1644  putative esterase  23.2 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0079  putative esterase  26.13 
 
 
360 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  31.65 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2354  tributyrin esterase EstA, putative  23.36 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1185  tributyrin esterase  25.33 
 
 
262 aa  56.6  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5149  putative esterase  27.11 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3665  putative esterase  24.81 
 
 
307 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  30.95 
 
 
268 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2723  putative esterase  23.25 
 
 
261 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1151  esterase  24.14 
 
 
260 aa  55.5  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000030129  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  27.31 
 
 
341 aa  54.7  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3922  putative esterase  27.2 
 
 
333 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.079767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1546  putative esterase  23.1 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828639  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  25.33 
 
 
401 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1859  putative esterase  23.45 
 
 
383 aa  52  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0625  putative esterase  24.88 
 
 
255 aa  52.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000135473  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  24.42 
 
 
375 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1609  putative esterase  27.11 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  24.46 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  24.46 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  28.07 
 
 
295 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1412  putative esterase  21.88 
 
 
359 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 
837 aa  49.7  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0800  putative esterase  26.62 
 
 
242 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1440  putative esterase  27.44 
 
 
316 aa  49.3  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.532369  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  30.7 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3200  putative esterase  25.44 
 
 
301 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0145665 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  31.58 
 
 
290 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>