23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1815 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1815  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  265  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.929005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1921  hypothetical protein  96.18 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3632  hypothetical protein  87.79 
 
 		 131 aa  240  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02314  hypothetical protein  71.21 
 
 		 132 aa  196  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.135968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01748  hypothetical protein  70.99 
 
 		 130 aa  193  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237016  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02315  hypothetical protein  68.94 
 
 		 132 aa  187  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.213951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3083  hypothetical protein  43.85 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0960  hypothetical protein  41.54 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0875  hypothetical protein  42.42 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.535908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0985  hypothetical protein  46.49 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.465893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3213  hypothetical protein  43.9 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3119  hypothetical protein  43.9 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0901  hypothetical protein  43.9 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129055  normal  0.931382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2921  hypothetical protein  43.24 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0858  hypothetical protein  44 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2823  hypothetical protein  41.74 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3645  hypothetical protein  44.74 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1042  hypothetical protein  42.98 
 
 		 137 aa  93.2  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0386254  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3317  hypothetical protein  42.98 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0973  hypothetical protein  42.98 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.373724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1010  hypothetical protein  42.98 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.0000237172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1075  hypothetical protein  42.15 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.101987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1596  hypothetical protein  34.18 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>