29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1726 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  407  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  56.63 
 
 		 199 aa  238  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3480  hypothetical protein  42.93 
 
 		 200 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01529  hypothetical protein  36.9 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003993  hypothetical protein  36.76 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.945378  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1475  hypothetical protein  36.46 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0695  hypothetical protein  32.24 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1544  hypothetical protein  29.51 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00234797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2256  hypothetical protein  29.02 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1331  hypothetical protein  27.72 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.921495  normal  0.485409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2288  hypothetical protein  29.5 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1731  hypothetical protein  28.64 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000442595  normal  0.728518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1812  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.028303  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1811  hypothetical protein  29.5 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1631  hypothetical protein  28.16 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000294763  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2832  hypothetical protein  28.12 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000632951  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2157  hypothetical protein  26.06 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2398  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249611  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2394  hypothetical protein  24.29 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000175566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2510  hypothetical protein  24.27 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0427588  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1953  hypothetical protein  24.29 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38277  normal  0.0743494 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2405  hypothetical protein  24.29 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00249071  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1675  hypothetical protein  23.61 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1606  type IV pilus assembly PilZ  27.12 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.0962013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2172  hypothetical protein  24.16 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25420  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1844  type IV pilus assembly PilZ  24.87 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1670  type IV pilus assembly PilZ  25.75 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1808  hypothetical protein  25.86 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>