63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_R0028 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0016  tRNA-Leu  98.85 
 
 		 88 bp  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0032  tRNA-Leu  98.82 
 
 		 85 bp  161  3e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0019  tRNA-Leu  98.82 
 
 		 85 bp  161  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000026789 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0007  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0422761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0005  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.936331 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0035  tRNA-Leu  96.47 
 
 		 85 bp  145  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.563034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0016  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 88 bp  143  8e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0046  tRNA-Leu  95.4 
 
 		 88 bp  141  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0006  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0582006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0011  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0023  tRNA-Leu  95.29 
 
 		 88 bp  137  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.248338  normal  0.650257 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0042  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 88 bp  133  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.552525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 88 bp  133  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 88 bp  133  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0020  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 88 bp  133  7.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.311496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 88 bp  133  7.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0041  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.415053 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0016  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0005  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 88 bp  109  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0009  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 88 bp  101  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0342668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0024  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 88 bp  93.7  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0022  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 88 bp  85.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00069315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0034  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 88 bp  85.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0444691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0034  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 100 bp  56  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0023  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0032  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0041  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0041  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 100 bp  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0034  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 97 bp  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.16425 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0505  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  96.3 
 
 		 516 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.219397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0101  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514478  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_513  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.44549  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.59905e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309348  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366383 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0019  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0017  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000138039  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309153  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309077  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309109  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.701033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>