32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1487 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  100 
 
 
154 aa  301  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  81.17 
 
 
160 aa  254  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  59.7 
 
 
157 aa  151  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  50 
 
 
122 aa  120  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  42.34 
 
 
157 aa  90.9  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  37.04 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  40.71 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  84.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  37.88 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  36.63 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  35.61 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  35.61 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  40.87 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  35.51 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  41.03 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  32.58 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  39.53 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2971  hypothetical protein  43.14 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  37.8 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2922  hypothetical protein  34.09 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.389384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  39.74 
 
 
185 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  35.71 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1541  hypothetical protein  34.88 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  28.68 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  35.59 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1995  hypothetical protein  31.51 
 
 
148 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  34.62 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  26.92 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  37.18 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  38.96 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  38.96 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>