32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04086 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04086  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  946    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4460  hypothetical protein  52.12 
 
 		 475 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267137  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3774  hypothetical protein  37.97 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01806  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  31.04 
 
 		 483 aa  306  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0684  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation permease component-like protein  35.86 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3609  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  34.88 
 
 		 478 aa  280  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000164741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2048  hypothetical protein  34.16 
 
 		 487 aa  199  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.598539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5322  hypothetical protein  26.16 
 
 		 476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  31.28 
 
 		 465 aa  173  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01817  hypothetical protein  30.21 
 
 		 470 aa  166  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0683  hypothetical protein  24.55 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  33.15 
 
 		 305 aa  59.7  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3333  hypothetical protein  21.12 
 
 		 449 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3359  hypothetical protein  24.6 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 322 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.3 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 352 aa  52  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  24.38 
 
 		 286 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.87 
 
 		 367 aa  50.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2072  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  31.03 
 
 		 334 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  30.4 
 
 		 354 aa  47  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  24.39 
 
 		 310 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  25.27 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  22.7 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.88 
 
 		 337 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  20.47 
 
 		 289 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.15 
 
 		 307 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 		 623 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  28.14 
 
 		 279 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  31.25 
 
 		 318 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  28.26 
 
 		 359 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>