31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03999 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  431  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  84.73 
 
 
504 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  78.43 
 
 
505 aa  339  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  74.76 
 
 
507 aa  331  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  74.27 
 
 
507 aa  330  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  74.76 
 
 
506 aa  331  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  74.75 
 
 
506 aa  329  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  72 
 
 
505 aa  321  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  72.5 
 
 
507 aa  320  8e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  73.37 
 
 
507 aa  318  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  72.36 
 
 
507 aa  313  9e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  72.36 
 
 
505 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  71.36 
 
 
505 aa  310  6.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  71.36 
 
 
507 aa  309  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  70.35 
 
 
515 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  60.4 
 
 
512 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  51.69 
 
 
503 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  54.11 
 
 
521 aa  251  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  51.21 
 
 
503 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  52.43 
 
 
512 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  50.49 
 
 
514 aa  236  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  54.95 
 
 
512 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  44.28 
 
 
507 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  40.8 
 
 
521 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  44.66 
 
 
512 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  44.66 
 
 
505 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  44.66 
 
 
507 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  36.18 
 
 
500 aa  156  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  30.14 
 
 
521 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  24.41 
 
 
544 aa  72.4  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  25.64 
 
 
541 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>