234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2969 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  189  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  86.6 
 
 		 97 aa  170  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  79.57 
 
 		 97 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  78.35 
 
 		 97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  77.78 
 
 		 102 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  65.91 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  60.23 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  56.67 
 
 		 93 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  57.47 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  65.38 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  54.55 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  58.43 
 
 		 93 aa  106  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  55.17 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  54.02 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  55.81 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  52.27 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4224  hypothetical protein  56.98 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.39415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1887  hypothetical protein  50.56 
 
 		 94 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  55.68 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3513  protein of unknown function DUF156  45.98 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1583  NreA protein  55.56 
 
 		 63 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1453  NreA protein  49.21 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0385778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  43.94 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  36.23 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  40.91 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  44.64 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  38.03 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  42.42 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  42.42 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  40.58 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  37.35 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  33.73 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  35.14 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  36.99 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  39.39 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1694  protein of unknown function DUF156  36.49 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.656008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  37.68 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  37.31 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  34.52 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  35.9 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  38.24 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  32.97 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  40 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  40.68 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  39.39 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  40 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0212  protein of unknown function DUF156  40.98 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.050462  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  35 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  36.84 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  37.68 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  34.12 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  37.68 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  37.68 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  44.12 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  44.12 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  36.25 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  35.21 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  36.99 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  38.71 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  31.91 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  42.65 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  42.65 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3691  hypothetical protein  34.78 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.32018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  32.93 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  37.88 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  36.76 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1421  hypothetical protein  36.11 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0973225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  40.35 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3746  hypothetical protein  51.16 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3147  hypothetical protein  39.34 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  36.36 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  36.67 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  36 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  34.43 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  37.93 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  34.43 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  35 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0914  hypothetical protein  46.3 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1007  protein of unknown function DUF156  35.63 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  37.29 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0617  hypothetical protein  34.72 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  35.21 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0538  hypothetical protein  34.72 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0774012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2851  hypothetical protein  46.3 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  35 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>