26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2076 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3388  hypothetical protein  91.12 
 
 		 890 aa  1553    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2076  hypothetical protein  100 
 
 		 907 aa  1863    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2555  hypothetical protein  87.68 
 
 		 893 aa  1541    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0784623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3667  hypothetical protein  90.67 
 
 		 890 aa  1547    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2369  hypothetical protein  96.85 
 
 		 890 aa  1660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  27.75 
 
 		 887 aa  280  9e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  25.57 
 
 		 875 aa  74.7  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  21.09 
 
 		 949 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00498  hypothetical protein  22.03 
 
 		 780 aa  63.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10002  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  21.83 
 
 		 852 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  22.94 
 
 		 893 aa  62  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  22.08 
 
 		 945 aa  58.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  22.93 
 
 		 944 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00492  hypothetical protein  22.83 
 
 		 770 aa  56.2  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.998785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  21.77 
 
 		 944 aa  54.7  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  22 
 
 		 1007 aa  52.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  22.45 
 
 		 856 aa  52.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  21.09 
 
 		 862 aa  52.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  22.43 
 
 		 944 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  23.69 
 
 		 925 aa  47.8  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3236  hypothetical protein  27.45 
 
 		 996 aa  47  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2299  hypothetical protein  27.45 
 
 		 996 aa  47  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.784864  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  21.92 
 
 		 880 aa  46.2  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2115  hypothetical protein  27.32 
 
 		 996 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  29.41 
 
 		 960 aa  44.3  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1160 aa  44.3  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>