88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1591 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 105 aa  210  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0135349  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17021  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  97.14 
 
 		 105 aa  205  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.495759  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16791  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  86.27 
 
 		 105 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2032  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  72.34 
 
 		 104 aa  154  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16211  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  74.19 
 
 		 116 aa  153  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.904726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0310  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  69.15 
 
 		 106 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  68.82 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  68.48 
 
 		 123 aa  140  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.954585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1065  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  68.48 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140967  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16901  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0690  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.78 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1121  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.66 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.570443  hitchhiker  0.00780778 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1186  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50.54 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000837739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1157  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50.54 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1638  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  47.42 
 
 		 97 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203824 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0673  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.69 
 
 		 92 aa  95.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.69 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1275  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  52.22 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1015  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  44.09 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.50735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5003  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  46.67 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.335893 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09991  ATP-dependent Clp protease adaptor  36.9 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10011  ATP-dependent Clp protease adaptor  36.9 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26351  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.88 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  30.77 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7525  predicted protein  33.33 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15141  hypothetical protein  32.63 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1444  ATP-dependent Clp protease adaptor  30 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.127411 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0940  ATP-dependent Clp protease adaptor  36.49 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.457767  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1367  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.24 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00775244  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1430  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.37 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.435578  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13951  ATP-dependent Clp protease adaptor  31.91 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0595  ATP-dependent Clp protease adaptor  31.91 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.758413  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2161  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.08 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.156597  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15521  ATP-dependent Clp protease adaptor  31.17 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.206963 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1533  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.79 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.344348  normal  0.976372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2843  ATP-dependent Clp protease adaptor  25.77 
 
 		 108 aa  47.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.331894 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43896  predicted protein  35.21 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2100  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.62 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.438966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2482  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  44.64 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2265  ATP-dependent Clp protease adaptor  36.11 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193826  normal  0.638389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1116  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.97 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1729  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  28 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.24 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1753  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.43 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08330  hypothetical protein  29.03 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3135  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.82 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174383  normal  0.142786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2020  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  46.03 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1768  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.31 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.986908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3193  ATP-dependent Clp protease adaptor  39.29 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1571  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.31 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0174248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0788  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.66 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.104793 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0836  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.04 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0838  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.96 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2261  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.57 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000149249  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0842  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.96 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2086  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.35 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.160673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5656  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.08 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0476  ATP-dependent Clp protease adaptor  26.32 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1055  ATP-dependent Clp protease adaptor  26.67 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0500253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0042  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  44.64 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00150413  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2110  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  41.67 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2538  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40.79 
 
 		 117 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.349109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0386  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.06 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1170  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  44.44 
 
 		 136 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2770  ATP-dependent Clp protease adaptor  34.21 
 
 		 103 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.833115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2796  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32 
 
 		 107 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366764  normal  0.0194317 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1127  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  44.44 
 
 		 136 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0417785  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0861  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  38.71 
 
 		 131 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.292535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1236  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.62 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.703886  normal  0.878448 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1285  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.65 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.154759  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1885  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.29 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  hitchhiker  0.000000637216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4057  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.5 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0910653  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1113  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.86 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0790  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.66 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0544  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.05 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.44 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136994  normal  0.22339 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2534  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.34 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3875  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.33 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3857  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.67 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2245  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.5 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.028928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0686  ATP-dependent Clp protease adaptor protein clpS  32.89 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0459  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.62 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.611884 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2341  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.89 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.239107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29230  hypothetical protein  26.83 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3203  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.39 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5344  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.66 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.431551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4801  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  37.66 
 
 		 112 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0991896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>