More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0829 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0829  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
318 aa  656    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  98.01 
 
 
318 aa  614  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  64.15 
 
 
318 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  61.01 
 
 
318 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1482  ornithine carbamoyltransferase  64.78 
 
 
318 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.278648  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13061  ornithine carbamoyltransferase  63.64 
 
 
318 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.250396 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14241  ornithine carbamoyltransferase  60.13 
 
 
308 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.256907  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1357  ornithine carbamoyltransferase  58.28 
 
 
308 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14621  ornithine carbamoyltransferase  58.8 
 
 
308 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14481  ornithine carbamoyltransferase  56.95 
 
 
308 aa  377  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  58.19 
 
 
306 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  57.86 
 
 
306 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  56.58 
 
 
305 aa  358  6e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  54.9 
 
 
309 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  54.1 
 
 
309 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 
306 aa  356  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  53.77 
 
 
309 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  56.86 
 
 
304 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
302 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 
304 aa  315  6e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
314 aa  315  8e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1176  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 
311 aa  309  4e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1394  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 
311 aa  308  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.819554  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 
309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 
307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 
313 aa  306  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
309 aa  305  6e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  48.33 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  48.3 
 
 
298 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  47.9 
 
 
309 aa  301  9e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
317 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 
303 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 
312 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
315 aa  299  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  45.07 
 
 
305 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  48.69 
 
 
309 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
355 aa  299  5e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  47.83 
 
 
305 aa  298  6e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
312 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
303 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 
340 aa  296  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  50.7 
 
 
305 aa  296  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
313 aa  295  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  48.48 
 
 
301 aa  293  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  50.35 
 
 
305 aa  293  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 
303 aa  293  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  46.01 
 
 
323 aa  292  5e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1048  ornithine carbamoyltransferase  44.81 
 
 
316 aa  292  6e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  46.38 
 
 
299 aa  292  6e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  48.32 
 
 
308 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  44.82 
 
 
303 aa  287  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 
323 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  47.57 
 
 
320 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 
312 aa  286  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
312 aa  285  8e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  45.31 
 
 
313 aa  285  8e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
309 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  47.33 
 
 
302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 
316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  46.82 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  44.66 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 
316 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  44.22 
 
 
305 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  44.82 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 
316 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  43.81 
 
 
303 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0777  ornithine carbamoyltransferase  44.07 
 
 
296 aa  282  7.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.500854 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  44.69 
 
 
312 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  47.18 
 
 
300 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 
316 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 
300 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 
317 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  47.44 
 
 
309 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  47.44 
 
 
309 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1497  ornithine carbamoyltransferase  45.24 
 
 
297 aa  281  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.651165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  45.97 
 
 
316 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  45.82 
 
 
316 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  45.31 
 
 
312 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  45.16 
 
 
321 aa  279  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  46.96 
 
 
309 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 
304 aa  277  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  44.34 
 
 
309 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  46.6 
 
 
300 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  45.64 
 
 
307 aa  275  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 
304 aa  275  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
303 aa  275  8e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  42.49 
 
 
338 aa  275  9e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  48.7 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  45.3 
 
 
298 aa  273  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 
312 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  45.51 
 
 
300 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>