17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54531 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_54531  predicted protein  100 
 
 
558 aa  1152    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737555  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06913  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13620)  25.6 
 
 
630 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01760  hypothetical protein  20.72 
 
 
708 aa  68.2  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  26.54 
 
 
1490 aa  54.7  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  23.9 
 
 
848 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  32 
 
 
618 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  29.29 
 
 
1340 aa  50.8  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  43.33 
 
 
631 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37903  deubiquitinating enzyme  26.7 
 
 
481 aa  48.5  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.816359  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  31.82 
 
 
1418 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  30.95 
 
 
688 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  33.87 
 
 
565 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46080  predicted protein  24.36 
 
 
1370 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  28.15 
 
 
1183 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  35.82 
 
 
316 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
576 aa  43.5  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46292  predicted protein  26.72 
 
 
772 aa  43.5  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>