20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32283 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_32283  Exosome complex exonuclease RRP46 (Ribosomal RNA processing protein 46)  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0605509  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04940  conserved hypothetical protein  40.22 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.189992  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16766  predicted protein  34.35 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614591  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  27.62 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  27.96 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  29.36 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  25.45 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14569  predicted protein  28.67 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0889855 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  28.29 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  24.09 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  32.82 
 
 		 274 aa  52.4  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  23.94 
 
 		 501 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  23.68 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  28.38 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  23.18 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  24.75 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03812  exosome complex endonuclease 1/ribosomal RNA processing protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03740)  28.99 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.904479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  22.08 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2811  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.13 
 
 		 702 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>