96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31253 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_31253  predicted protein  100 
 
 		 266 aa  536  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35800  predicted protein  62.12 
 
 		 264 aa  343  2e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35799  predicted protein  52.08 
 
 		 272 aa  272  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0356533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38314  putative transporter  48.52 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.801192  normal  0.297491 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  46.85 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83722  Accumulation of DYads  39.31 
 
 		 274 aa  195  7e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33707  predicted protein  39.23 
 
 		 274 aa  178  7e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.373247  hitchhiker  0.000185367 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01839  conserved hypothetical protein  31.96 
 
 		 293 aa  138  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.009571  normal  0.645979 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02960  conserved hypothetical protein  39.06 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.392793  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03640  membrane protein, putative  33.17 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0291661  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05226  Acetate permeasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2K4]  36.71 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.719404  normal  0.707615 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02140  conserved hypothetical protein  30.31 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07317  conserved hypothetical protein  34.88 
 
 		 221 aa  90.1  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0696491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  27.6 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00366  conserved hypothetical protein  29.79 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.198707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.57 
 
 		 201 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.16 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.94 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.85 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.22 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.8 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  28.42 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.63 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.81 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0228  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.77 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.98 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  28.83 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.98 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0212  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.77 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0761648 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  28.95 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1352  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.49 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000041614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1305  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.64 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  26.94 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0065  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.51 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1327  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.32 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.39924  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  24.74 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  24.74 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  24.74 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  24.74 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.21 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  27.45 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  27.45 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  28.42 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  28.42 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  27.45 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.72 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  24.74 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  27.75 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  27.84 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1065  putative regulatory protein  26.26 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  25 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.36 
 
 		 195 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  30.73 
 
 		 190 aa  53.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  28.19 
 
 		 191 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  27.66 
 
 		 191 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  25.4 
 
 		 183 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2076  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.49 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  24.61 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0634  GPR1/FUN34/yaaH  24.34 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0870411  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2423  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.71 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542283  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1357  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.98 
 
 		 194 aa  50.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  25.13 
 
 		 188 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  25.13 
 
 		 188 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.13 
 
 		 188 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  25.13 
 
 		 188 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  25.13 
 
 		 188 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  25.13 
 
 		 188 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  25.13 
 
 		 188 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  24.21 
 
 		 188 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.41 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1320  membrane protein  29.7 
 
 		 183 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1348  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.93 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00408603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.63 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  25.13 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.65 
 
 		 189 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  22.97 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1253  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30 
 
 		 194 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25 
 
 		 189 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  23.65 
 
 		 189 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.65 
 
 		 189 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2772  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.5 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.713345  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1067  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.28 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00312411  normal  0.445935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  23.56 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1604  hypothetical protein  27.55 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00253793  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.06 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  22.77 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.78 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.84 
 
 		 187 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.86 
 
 		 187 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.56 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0364  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.32 
 
 		 186 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0187  hypothetical protein  30.25 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.480658 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  25.12 
 
 		 196 aa  42.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  24.88 
 
 		 197 aa  42  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0904  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.8 
 
 		 188 aa  42  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>