110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0187 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0187  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  434  1e-121  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.480658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1352  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.83 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000041614  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.17 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.51 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  31.84 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  27.96 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2076  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.57 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  28.72 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  28.72 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  28.72 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  28.26 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  27.72 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  27.72 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0065  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.19 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  27.17 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.04 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  28.11 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.33 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.37 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  28.72 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02960  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
257 aa  63.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.392793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.32 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  28.72 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1253  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.81 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  27.42 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  27.42 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  27.42 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  27.42 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1305  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.17 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.28 
 
 
197 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  27.42 
 
 
188 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.79 
 
 
183 aa  61.6  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  28.04 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2835  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.57 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.244228  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1327  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.49 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.39924  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  32.39 
 
 
258 aa  58.9  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.56 
 
 
207 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  28.76 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  28.72 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  28.3 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.26 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  29.47 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.12 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  26.09 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.24 
 
 
196 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38314  putative transporter  28.04 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.801192  normal  0.297491 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  24.73 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.73 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  26.18 
 
 
197 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  24.73 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  24.73 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  24.73 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  24.73 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1348  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.82 
 
 
197 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00408603 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  24.73 
 
 
188 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31253  predicted protein  27.01 
 
 
266 aa  55.5  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3251  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.74 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000382822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  24.73 
 
 
188 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05226  Acetate permeasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2K4]  37.97 
 
 
298 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.719404  normal  0.707615 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3245  GPR1/FUN34/YaaH family protein  24.74 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1320  membrane protein  28.57 
 
 
183 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2772  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.02 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.713345  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.98 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01839  conserved hypothetical protein  27.7 
 
 
293 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.009571  normal  0.645979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3336  hypothetical protein  24.74 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000909805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3301  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.74 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.83805e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1224  transcriptional regulator  31.31 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3597  hypothetical protein  24.74 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  23.47 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.88 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.98 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3560  hypothetical protein  24.74 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3650  hypothetical protein  24.74 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1667  hypothetical protein  24.74 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  hitchhiker  6.45658e-23 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.39 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0364  GPR1/FUN34/yaaH family protein  27.46 
 
 
186 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  24.19 
 
 
188 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3556  hypothetical protein  24.74 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000310297  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02140  conserved hypothetical protein  29.29 
 
 
281 aa  52.8  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3551  hypothetical protein  24.74 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8351e-43 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.87 
 
 
189 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.87 
 
 
189 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.16 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  25.63 
 
 
197 aa  52  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.76 
 
 
195 aa  52  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83722  Accumulation of DYads  26.92 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  24.35 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  30.48 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.5 
 
 
187 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0999  hypothetical protein  25.4 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.62 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.4 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0228  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.79 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0634  GPR1/FUN34/yaaH  23.27 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0870411  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1067  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.41 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00312411  normal  0.445935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.12 
 
 
187 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.93 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1357  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.77 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0212  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.08 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0761648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1006  GPR1/FUN34/yaaH family protein  31.65 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0753776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>