45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29898 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  70.32 
 
 		 468 aa  699    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  68.45 
 
 		 463 aa  639    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  100 
 
 		 484 aa  981    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  62.83 
 
 		 462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  62.53 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  44.39 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  44.65 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  42.89 
 
 		 455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  43.24 
 
 		 450 aa  353  4e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  42.34 
 
 		 450 aa  349  8e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  41.32 
 
 		 484 aa  347  4e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  42.73 
 
 		 448 aa  346  5e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  42.57 
 
 		 459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  41.91 
 
 		 451 aa  343  5e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.252738 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  42.66 
 
 		 458 aa  341  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  44.04 
 
 		 452 aa  340  2e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.739423 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  41.5 
 
 		 485 aa  336  5e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  45.41 
 
 		 452 aa  335  1e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  41.36 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002885  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.44 
 
 		 701 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00493528  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.98 
 
 		 642 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.98 
 
 		 642 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0544  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.98 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.98 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.98 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1826  deoxynucleoside kinase family protein  28.76 
 
 		 213 aa  48.9  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  36.23 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.04 
 
 		 643 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.04 
 
 		 643 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.04 
 
 		 643 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.04 
 
 		 643 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.04 
 
 		 643 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  33.04 
 
 		 643 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.04 
 
 		 643 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.04 
 
 		 643 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.04 
 
 		 643 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1085  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.95 
 
 		 714 aa  47.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  34.78 
 
 		 371 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.28 
 
 		 664 aa  47.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0950  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.25 
 
 		 642 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.194828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.4 
 
 		 678 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  37.31 
 
 		 775 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.32 
 
 		 939 aa  43.9  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 371 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.4 
 
 		 685 aa  43.5  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>